A ecologia aplicada é o ramo da ecologia que se ocupa da aplicação de princípios ecológicos ao manejo dos recursos naturais, produção animal e problemas de poluição ambiental, incluindo tudo que envolve o problema da introdução de espécies invasoras. Todos temas nos quais o LEBIO vem trabalhando e os membros de sua equipe já trabalhavam mesmo antes da criação do laboratório.

 

Muitos projetos foram coordenados pela equipe do LEBIO envolvendo, por exemplo, a dispersão do molusco invasor Limnoperna fortunei, o mexilhão dourado, pela América do Sul, seu monitoramento, desenvolvimento de modelos de análise de risco de sua dispersão, sua biologia e seu controle em sistemas industriais, como os sistemas de resfriamento de usinas hidrelétricas. Com a experiência adquirida com o mexilhão dourado, outras espécies invasoras também se tornaram foco de vários projetos de pesquisa. 

 

A experiência com o setor elétrico brasileiro também trouxe projetos de estudos para licenciamento ambiental e de pesquisas na área de conservação, como projetos nas áreas de corredores de biodiversidade, levantamanto e monitoramento de fauna, além de vários serviços ambientais ao setor.